تأسس القسم إبان الثورة التحريرية -خلال 1958م- باسم مدرسة المسجد، ويحتضن التلاميذ –البنين- من المرحلتين الابتدائية والمتوسطة في طرفي النهار، يتلقون فيها مناهج خاصة لتحفيظ القرآن الكريم وتعليم اللغة العربية ومبادئ العلوم الشرعية وآدابها، في فروع ومقرات عديدة موزعة على أحياء مدينة غرداية وواحاتها، وذلك تكملة للمناهج العامة التي يتلقونها في المدارس الحكومية خلال وجه النهار.